Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGSF1Q8N6C5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF1Q8N6C5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms