Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SVBPQ8N300 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SVBPQ8N300 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms