Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA4Q8IV77 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA4Q8IV77 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms