Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX29P2Q8IUI4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms