Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01551Q86U37 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms