Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP1Q7RTM1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP1Q7RTM1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms