Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP43Q70EL4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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