Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf139Q6ZV77 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf139Q6ZV77 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms