Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms