Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL54Q6P161 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms