Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms