Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP4R4Q6NUP7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP4R4Q6NUP7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms