Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms