Protein–RNA interactions for Protein: Q5U623

ATF7IP2, Activating transcription factor 7-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IP2Q5U623 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF7IP2Q5U623 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms