Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIA9

CBWD5, COBW domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD5Q5RIA9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBWD5Q5RIA9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms