Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC158Q5M9N0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms