Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCID2Q5JVF3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms