Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q499Y3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q499Y3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q499Y3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q499Y3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q499Y3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q499Y3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q499Y3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms