Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS9Q3SYG4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms