Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT71Q3SY84 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms