Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms