Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSR1Q2NL82 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR1Q2NL82 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms