Protein–RNA interactions for Protein: Q24JQ0

TMEM241, Transmembrane protein 241, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM241Q24JQ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM241Q24JQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM241Q24JQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms