Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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