Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CRY1Q16526 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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CRY1Q16526 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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CRY1Q16526 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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CRY1Q16526 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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CRY1Q16526 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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CRY1Q16526 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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CRY1Q16526 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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CRY1Q16526 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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CRY1Q16526 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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