Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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