Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATP6AP1Q15904 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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