Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYTH1Q15438 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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CYTH1Q15438 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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CYTH1Q15438 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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CYTH1Q15438 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CYTH1Q15438 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CYTH1Q15438 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CYTH1Q15438 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CYTH1Q15438 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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