Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABEP1Q15276 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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