Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HDM1Q15032 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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