Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SQLEQ14534 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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