Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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