Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCINQ13939 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCINQ13939 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCINQ13939 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCINQ13939 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCINQ13939 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCINQ13939 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCINQ13939 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCINQ13939 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCINQ13939 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCINQ13939 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCINQ13939 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCINQ13939 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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