Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H2Q13888 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms