Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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