Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP1Q13829 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP1Q13829 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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