Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LSAMPQ13449 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LSAMPQ13449 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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