Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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