Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNTA1Q13424 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms