Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSLNQ13421 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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