Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DYNC1I2Q13409 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DYNC1I2Q13409 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms