Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3FQ13275 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3FQ13275 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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