Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1BQ13112 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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