Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FOXD4Q12950 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4Q12950 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms