Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 RAD50YNL250W 3939 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 SOL3YHR163W 750 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 PSR1YLL010C 1284 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 YOR238WYOR238W 912 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 YSA1YBR111C 696 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 VPS34YLR240W 2628 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 YKR078WYKR078W 1758 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 SWD2YKL018W 990 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 YBT1YLL048C 4986 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 SNU114YKL173W 3027 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 PMT4YJR143C 2289 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 ECM7YLR443W 1347 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 YDL162CYDL162C 357 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 SAE2YGL175C 1038 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 ORM1YGR038W 669 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 TRM7YBR061C 933 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 YIL024CYIL024C 570 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 IDH2YOR136W 1110 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 MRM1YOR201C 1239 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 ARA1YBR149W 1035 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 NAT1YDL040C 2565 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 CDC55YGL190C 1581 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 SGM1YJR134C 2124 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 UTP14YML093W 2700 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 FAF1YIL019W 1041 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YIR040CYIR040C 333 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YBL012CYBL012C 402 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YBR287WYBR287W 1284 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YDL041WYDL041W 354 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YVH1YIR026C 1095 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 JJJ3YJR097W 519 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 OST6YML019W 999 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 SPR28YDR218C 1272 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 MMM1YLL006W 1281 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 TPT1YOL102C 693 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YAR1YPL239W 603 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 ECM29YHL030W 5607 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 PCD1YLR151C 1023 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YHC1YLR298C 696 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YOR392WYOR392W 444 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 SCH9YHR205W 2475 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 RPL27BYDR471W 411 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YLR428CYLR428C 345 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 GPB1YOR371C 2694 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 UBP12YJL197W 3765 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 LTE1YAL024C 4308 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 THI22YPR121W 1719 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 ADK1YDR226W 669 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 SNM1YDR478W 597 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YPR077CYPR077C 372 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 TRM732YMR259C 4263 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 SPC72YAL047C 1869 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 NUM1YDR150W 8247 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 YLR230WYLR230W 306 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 CUS2YNL286W 858 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 HEM4YOR278W 828 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 MDM20YOL076W 2391 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 SHE4YOR035C 2370 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 RKM3YBR030W 1659 nt2.65□□□□□ -1.98
TY1B-GR3Q12316 ADY4YLR227C 1482 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 HYP2YEL034W 474 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 AML1YGR001C 747 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 IOC3YFR013W 2364 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 FAB1YFR019W 6837 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 VHR2YER064C 1518 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 RUF21RUF21 707 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 MSN4YKL062W 1893 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 NCB2YDR397C 441 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 ERT1YBR239C 1590 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 CHS1YNL192W 3396 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 YLL047WYLL047W 384 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 TMA16YOR252W 537 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 MUD1YBR119W 897 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 YJL181WYJL181W 1836 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 PIB1YDR313C 861 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 SEC28YIL076W 891 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 PRT1YOR361C 2292 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 IML1YJR138W 4755 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 FRE2YKL220C 2136 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 KOG1YHR186C 4674 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 YOS1YER074W-A 258 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 PAI3YMR174C 207 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 SSU72YNL222W 621 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 SKN7YHR206W 1869 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 DSL1YNL258C 2265 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 SNX41YDR425W 1878 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 RTS3YGR161C 792 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 IKI1YHR187W 930 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 YGR130CYGR130C 2451 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1B-GR3Q12316 TVP15YDR100W 432 nt2.6□□□□□ -1.99
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