Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDR1Q08345 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDR1Q08345 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms