Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN3Q08043 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN3Q08043 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN3Q08043 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN3Q08043 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN3Q08043 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms