Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN1BQ07699 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms