Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms