Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN1Q05586 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN1Q05586 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms